Num futuro próximo, quando uma nova tecnologia se desenvolveu. Nas redes sociais, circulam rumores sobre um fenómeno estranho e desconhecido chamado "fantasmas holográficos". Hiro Amanokawa, um estudante do primeiro ano do ensino secundário, ativa um dispositivo misterioso chamado "Digivice" que foi deixado pelo seu pai. Como resultado, ele consegue ver criaturas desconhecidas chamadas "Digimon" que são invisíveis para as pessoas comuns. Desde o dia em que conheceu Gammamon, um Digimon travesso que foi confiado a ele pelo seu pai, ele se envolve em uma variedade de fenómenos bizarros. O "Homem da Costura da Boca" que rouba o tempo dos humanos, o "Homem Mumificado" que vagueia à noite e sequestra pessoas... Os fantasmas holográficos estão bem ao nosso lado e estão à espreita. O que se segue é uma história do outro lado do mundo que ninguém conhece. Juntamente com Gammamon e os seus amigos, Hiro entra no mundo misterioso onde os Digimon vivem.