Ein Jahr ist seit den Ereignissen am Berg Minakami vergangen, Sho und Agito sind verschwunden, und Cronos hat die vollständige Kontrolle über die Welt übernommen und das Leben in vielen Bereichen beeinflusst. Tetsuro, Mizuki, Shizu und Yohei verstecken sich in einer kleinen Wohnung und warten auf die Rückkehr der Helden. Aptom spioniert sie aus und hält ihre Existenz sogar von Cronos fern, wenn die Behörden sie entdecken könnten. Auf Cronos führt Dr. Balcus ein mysteriöses Experiment an einer neuen Kreatur durch und erhält Besuch von Shin, einem der Zoalord-Götter, der ihn bittet, am Toten Meer einzugreifen, wo ein seltsames Phänomen auftritt.